A batalha continua enquanto Shirou continua a proteger Sakura, agora consumida pela escuridão. Ele une forças com Rin para acabar com a Guerra do Santo Graal, enquanto Illyasviel, que sabe a verdade por trás disso, confronta seu destino. Em meio ao caos, Zouken planeja manipular Sakura para satisfazer seus próprios desejos. A luta final começa.